Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q71RC1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q71RC1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q71RC1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q71RC1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q71RC1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q71RC1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q71RC1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q71RC1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q71RC1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q71RC1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q71RC1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q71RC1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms