Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1LQ6UX01 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1LQ6UX01 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBR1LQ6UX01 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBR1LQ6UX01 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms