Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms