Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms