Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms