Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms