Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC27A3Q5K4L6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms