Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERC4Q5GLZ8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms