Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms