Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP28Q4G0W2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms