Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms