Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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