Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDB1Q16531 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDB1Q16531 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDB1Q16531 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDB1Q16531 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDB1Q16531 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDB1Q16531 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DDB1Q16531 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DDB1Q16531 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DDB1Q16531 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDB1Q16531 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDB1Q16531 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDB1Q16531 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDB1Q16531 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
DDB1Q16531 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDB1Q16531 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDB1Q16531 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDB1Q16531 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDB1Q16531 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DDB1Q16531 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDB1Q16531 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDB1Q16531 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DDB1Q16531 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DDB1Q16531 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
DDB1Q16531 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms