Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC1Q15915 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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