Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS72Q15906 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms