Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD6Q15008 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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