Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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