Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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