Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYO1EQ12965 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms