Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt4.44□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YPL107WYPL107W 747 nt4.44□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 PRM1YNL279W 1986 nt4.44□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 NCS2YNL119W 1482 nt4.43□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 MAG2YLR427W 2013 nt4.43□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 HNT1YDL125C 477 nt4.43□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 RPB3YIL021W 957 nt4.43□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YNL184CYNL184C 327 nt4.43□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 AYT1YLL063C 1425 nt4.43□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 AKL1YBR059C 3327 nt4.43□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 SYF1YDR416W 2580 nt4.43□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 LST4YKL176C 2487 nt4.43□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 TPD3YAL016W 1908 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 THS1YIL078W 2205 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 OLE1YGL055W 1533 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 PRP11YDL043C 801 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 CDC55YGL190C 1581 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YAL065CYAL065C 387 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 UBC7YMR022W 498 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 CDC33YOL139C 642 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YOR121CYOR121C 306 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YOR277CYOR277C 309 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 ATP3YBR039W 936 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YPR096CYPR096C 303 nt4.42□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 SWT1YOR166C 1377 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 KGD1YIL125W 3045 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YPS7YDR349C 1791 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 BSC2YDR275W 708 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YLR269CYLR269C 351 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 MRPL39YML009C 213 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YOR203WYOR203W 354 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YBR032WYBR032W 303 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YPL276WYPL276W 438 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 APC4YDR118W 1959 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 KIC1YHR102W 3243 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 YMR221CYMR221C 1515 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 HAA1YPR008W 2085 nt4.41□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 TAF12YDR145W 1620 nt4.4□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 SSB2YNL209W 1842 nt4.4□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 FUS2YMR232W 2034 nt4.4□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 SKG6YHR149C 2205 nt4.4□□□□□ -1.7
NSI1Q12457 SRD1YCR018C 666 nt4.4□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 RSM25YIL093C 795 nt4.4□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 MNN1YER001W 2289 nt4.4□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 RPN6YDL097C 1305 nt4.4□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 TAF5YBR198C 2397 nt4.4□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 RPN3YER021W 1572 nt4.4□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 DSL1YNL258C 2265 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 BFR1YOR198C 1413 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 MSS4YDR208W 2340 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 DPH1YIL103W 1278 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 YJR038CYJR038C 363 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 ARG80YMR042W 534 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 CDC15YAR019C 2925 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 SDS23YGL056C 1584 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 SWP82YFL049W 1872 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 CDC5YMR001C 2118 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 SHE4YOR035C 2370 nt4.39□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 SEN1YLR430W 6696 nt4.38□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 CTM1YHR109W 1758 nt4.38□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 ATM1YMR301C 2073 nt4.38□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 Q0143Q0143 153 nt4.38□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 OTU2YHL013C 924 nt4.38□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 NNF1YJR112W 606 nt4.38□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 APC1YNL172W 5247 nt4.38□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 RIM4YHL024W 2142 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 YML096WYML096W 1578 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 RPS14AYCR031C 414 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 BCP1YDR361C 852 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 YDR431WYDR431W 312 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 BNA6YFR047C 888 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 YGR053CYGR053C 852 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 COX18YGR062C 951 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 RAD14YMR201C 1116 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 GRE2YOL151W 1029 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 YER077CYER077C 2067 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 SAP4YGL229C 2457 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 OPT2YPR194C 2634 nt4.37□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 FAA1YOR317W 2103 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 CPR5YDR304C 678 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 SDH7YDR511W 402 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 PIR1YKL164C 1026 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 TEN1YLR010C 483 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 PAI3YMR174C 207 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 SHG1YBR258C 429 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 SWI3YJL176C 2478 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 CHA4YLR098C 1947 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 SAF1YBR280C 1914 nt4.36□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 YDR102CYDR102C 333 nt4.35□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 DPB4YDR121W 591 nt4.35□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 ATP8Q0080 147 nt4.35□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.35□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.35□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.35□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.35□□□□□ -1.71
NSI1Q12457 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.9 ms