Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 STP1YDR463W 1560 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 SIN4YNL236W 2925 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 CBP2YHL038C 1893 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 LRS4YDR439W 1044 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 PAU10YDR542W 363 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 PAU11YGL261C 363 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 TAM41YGR046W 1158 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 PAU13YHL046C 363 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YHR097CYHR097C 1101 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 SNX4YJL036W 1272 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 ECM9YKR004C 1134 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 PAU4YLR461W 363 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 OCA2YNL056W 594 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YSF3YNL138W-A 258 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 TDA1YMR291W 1761 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 RAD18YCR066W 1464 nt3.27□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 CDC5YMR001C 2118 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 AXL1YPR122W 3627 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 LIF1YGL090W 1266 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 RNR2YJL026W 1200 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YLR230WYLR230W 306 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 RIM9YMR063W 720 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YBR053CYBR053C 1077 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 POL30YBR088C 777 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 ROG1YGL144C 2058 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 BCK1YJL095W 4437 nt3.26□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YJL049WYJL049W 1353 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 ERP3YDL018C 678 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 RMT2YDR465C 1239 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 CGR1YGL029W 363 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YIP5YGL161C 933 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YIR014WYIR014W 729 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 NNF1YJR112W 606 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YLR050CYLR050C 486 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 PBA1YLR199C 831 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 BUR2YLR226W 1188 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 RLP7YNL002C 969 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 snR24snR24 89 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 KAR4YCL055W 1008 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 SRO77YBL106C 3033 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 DBP10YDL031W 2988 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 PIG2YIL045W 1617 nt3.25□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 ALG8YOR067C 1734 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YDL199CYDL199C 2064 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YME2YMR302C 2553 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 ESA1YOR244W 1338 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 BMH2YDR099W 822 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 NGG1YDR176W 2109 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 ECM11YDR446W 909 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 RMD6YEL072W 696 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 SEC4YFL005W 648 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 PGD1YGL025C 1194 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YGL109WYGL109W 324 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YCL007CYCL007C 393 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 AEP2YMR282C 1743 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 TOP1YOL006C 2310 nt3.24□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 FRE2YKL220C 2136 nt3.23□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.23□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 EXO70YJL085W 1872 nt3.23□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YNL276CYNL276C 396 nt3.23□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YAP7YOL028C 738 nt3.23□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 BRX1YOL077C 876 nt3.23□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YOR203WYOR203W 354 nt3.23□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 NMA111YNL123W 2994 nt3.23□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 EBS1YDR206W 2655 nt3.23□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 KRE2YDR483W 1329 nt3.22□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.22□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 HMO1YDR174W 741 nt3.22□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YHR180WYHR180W 492 nt3.22□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 YML096WYML096W 1578 nt3.21□□□□□ -1.89
LSP1Q12230 RSE1YML049C 4086 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YPD1YDL235C 504 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YDR248CYDR248C 582 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 COBQ0105 1158 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 BET5YML077W 480 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 RRP15YPR143W 753 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 ARL1YBR164C 552 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 MIP6YHR015W 1980 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 NSA1YGL111W 1392 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 PRP8YHR165C 7242 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 JSN1YJR091C 3276 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 RSN1YMR266W 2862 nt3.21□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 CCM1YGR150C 2595 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 AGE1YDR524C 1449 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 GIN4YDR507C 3429 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 IKI3YLR384C 4050 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 KIN82YCR091W 2163 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 CLB3YDL155W 1284 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 MFA1YDR461W 111 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YGR226CYGR226C 210 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 LIN1YHR156C 1023 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 CPR7YJR032W 1182 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 VMA6YLR447C 1038 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YOR387CYOR387C 621 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YPR147CYPR147C 915 nt3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.3 ms