Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 URB2YJR041C 3525 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SEC26YDR238C 2922 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 RIM13YMR154C 2184 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YGL176CYGL176C 1665 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 GCD10YNL062C 1437 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 POL3YDL102W 3294 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 ROG1YGL144C 2058 nt2.49□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 GIN4YDR507C 3429 nt2.49□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 PPH3YDR075W 927 nt2.49□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 FMP32YFL046W 624 nt2.49□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YJL169WYJL169W 369 nt2.49□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 OMA1YKR087C 1038 nt2.49□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 ECM13YBL043W 774 nt2.49□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 DNL4YOR005C 2835 nt2.49□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 VPS13YLL040C 9435 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SVL3YPL032C 2478 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 AI3Q0060 1248 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YGR168CYGR168C 1131 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 PRM6YML047C 1059 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 TSR4YOL022C 1227 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 RRG7YOR305W 729 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 AIM4YBR194W 372 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 PBP2YBR233W 1242 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 RRP7YCL031C 894 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 UBP15YMR304W 3693 nt2.48□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 RIT1YMR283C 1542 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 DUG2YBR281C 2637 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YOL057WYOL057W 2136 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 VHR1YIL056W 1923 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SDS3YIL084C 984 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 PSY3YLR376C 729 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YNR068CYNR068C 819 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 PIS1YPR113W 663 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SSN2YDR443C 4263 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SNX41YDR425W 1878 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 ORC2YBR060C 1863 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SIR3YLR442C 2937 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 RPO41YFL036W 4056 nt2.47□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SAK1YER129W 3429 nt2.46□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YOL098CYOL098C 3114 nt2.46□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SEN54YPL083C 1404 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 DIG2YDR480W 972 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 SAW1YAL027W 786 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YKL070WYKL070W 510 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 ADI1YMR009W 540 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YNL171CYNL171C 369 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 PDR17YNL264C 1053 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 IZH4YOL101C 939 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 HSP10YOR020C 321 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 DAD3YBR233W-A 285 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 PHO2YDL106C 1680 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YNL193WYNL193W 1677 nt2.46□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 NEW1YPL226W 3591 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 RPL13AYDL082W 600 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 TDA10YGR205W 873 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 APC9YLR102C 798 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 PEX17YNL214W 600 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YOL166CYOL166C 339 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 GRX7YBR014C 612 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 RRG8YPR116W 834 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YBR209WYBR209W 318 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YPK1YKL126W 2043 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YDR061WYDR061W 1620 nt2.45□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 TMA64YDR117C 1698 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YDR131CYDR131C 1671 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 SLP1YOR154W 1764 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YME2YMR302C 2553 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 MFA1YDR461W 111 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YGR107WYGR107W 450 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 RSR1YGR152C 819 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YJR071WYJR071W 369 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 SRL3YKR091W 741 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 BTS1YPL069C 1008 nt2.44□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 MUB1YMR100W 1863 nt2.43□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 TCB2YNL087W 3537 nt2.43□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 ARP9YMR033W 1404 nt2.43□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 FIR1YER032W 2631 nt2.43□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.43□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.43□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 PFS1YHR185C 714 nt2.43□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 NNF1YJR112W 606 nt2.43□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 SFT1YKL006C-A 294 nt2.43□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 YMR099CYMR099C 894 nt2.43□□□□□ -2.02
MSH5Q12175 IRC14YOR135C 342 nt2.43□□□□□ -2.02
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