Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC15Q0P6D6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms