Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBL2Q08999 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBL2Q08999 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms