Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLEQ07864 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLEQ07864 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLEQ07864 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLEQ07864 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLEQ07864 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLEQ07864 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLEQ07864 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLEQ07864 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLEQ07864 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLEQ07864 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLEQ07864 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLEQ07864 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLEQ07864 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms