Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4BQ07343 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms