Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCZQ05513 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms