Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 DDR48YMR173W 1293 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 ATX1YNL259C 222 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 NGL1YOL042W 1092 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 FUN12YAL035W 3009 nt4.17□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 VAC7YNL054W 3498 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 SHS1YDL225W 1656 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YMR221CYMR221C 1515 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 BRE5YNR051C 1548 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 ECM4YKR076W 1113 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 RAD33YML011C 534 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 SIW14YNL032W 846 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YPR096CYPR096C 303 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 SNF2YOR290C 5112 nt4.16□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 PEX6YNL329C 3093 nt4.15□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 SEC6YIL068C 2418 nt4.15□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 TPA1YER049W 1935 nt4.15□□□□□ -1.74
SRP1Q02821 YDR537CYDR537C 606 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YER135CYER135C 393 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 MRPL20YKR085C 588 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 SEC22YLR268W 645 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 PDP3YLR455W 915 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YBL028CYBL028C 321 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 TIF11YMR260C 462 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 CMC2YBL059C-A 330 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 AIM4YBR194W 372 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 snR54snR54 86 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 EGT2YNL327W 3126 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 ASI1YMR119W 1875 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 APC5YOR249C 2058 nt4.15□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 UTP25YIL091C 2166 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 PPN1YDR452W 2025 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 AHC2YCR082W 387 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 SDP1YIL113W 630 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YJL086CYJL086C 369 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 RPA12YJR063W 378 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YLR076CYLR076C 423 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YML108WYML108W 318 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 RIM9YMR063W 720 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 RPS16AYMR143W 432 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YBR051WYBR051W 351 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 snR35snR35 204 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 STI1YOR027W 1770 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 PGS1YCL004W 1566 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 DPH6YLR143W 2058 nt4.14□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 GPI10YGL142C 1851 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 UPC2YDR213W 2742 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 ARF2YDL137W 546 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 RPL11BYGR085C 525 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 RTS3YGR161C 792 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YIL141WYIL141W 390 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YNL089CYNL089C 477 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 RPL11AYPR102C 525 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 SYO1YDL063C 1863 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YLR177WYLR177W 1887 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 MYO3YKL129C 3819 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 TGL3YMR313C 1929 nt4.13□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 PDR12YPL058C 4536 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 TRK1YJL129C 3708 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 FRT2YAL028W 1587 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 THI13YDL244W 1023 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 SWF1YDR126W 1011 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 SEC53YFL045C 765 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 MIC19YFR011C 513 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YAL004WYAL004W 648 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 ASC1YMR116C 960 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 RTC1YOL138C 4026 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 PIN4YBL051C 2007 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 IMH1YLR309C 2736 nt4.12□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 ULS1YOR191W 4860 nt4.11□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 ACE2YLR131C 2313 nt4.11□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 IRC2YDR112W 309 nt4.11□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 ERV1YGR029W 570 nt4.11□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt4.11□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt4.11□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 MDG1YNL173C 1101 nt4.11□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YOR053WYOR053W 342 nt4.11□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 PRM15YMR278W 1869 nt4.11□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YER006C-AYER006C-A 318 nt4.1□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 CGR1YGL029W 363 nt4.1□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 PET54YGR222W 882 nt4.1□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 BIG1YHR101C 1008 nt4.1□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YHR212CYHR212C 336 nt4.1□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 AGE2YIL044C 897 nt4.1□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.1□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.1□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YAR060CYAR060C 336 nt4.1□□□□□ -1.75
SRP1Q02821 YLR287CYLR287C 1068 nt4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms