Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms