Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms