Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms