Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOMO3P69849 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms