Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms