Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms