Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF3P57682 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLF3P57682 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLF3P57682 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLF3P57682 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms