Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB4P54760 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms