Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATXN3P54252 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN3P54252 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN3P54252 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN3P54252 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN3P54252 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN3P54252 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN3P54252 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATXN3P54252 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATXN3P54252 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATXN3P54252 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATXN3P54252 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATXN3P54252 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATXN3P54252 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATXN3P54252 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATXN3P54252 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATXN3P54252 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATXN3P54252 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATXN3P54252 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATXN3P54252 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATXN3P54252 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATXN3P54252 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATXN3P54252 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms