Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PIP4K2AP48426 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms