Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCTRP47872 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCTRP47872 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCTRP47872 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCTRP47872 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCTRP47872 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCTRP47872 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCTRP47872 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCTRP47872 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCTRP47872 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCTRP47872 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCTRP47872 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCTRP47872 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCTRP47872 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCTRP47872 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCTRP47872 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCTRP47872 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCTRP47872 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCTRP47872 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCTRP47872 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCTRP47872 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms