Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFRP42898 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms