Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECI1P42126 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECI1P42126 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECI1P42126 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECI1P42126 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECI1P42126 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECI1P42126 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ECI1P42126 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECI1P42126 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECI1P42126 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECI1P42126 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECI1P42126 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECI1P42126 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECI1P42126 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECI1P42126 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECI1P42126 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECI1P42126 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECI1P42126 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECI1P42126 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECI1P42126 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECI1P42126 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECI1P42126 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms