Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZEB1P37275 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZEB1P37275 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZEB1P37275 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZEB1P37275 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms