Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NF2P35240 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NF2P35240 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NF2P35240 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NF2P35240 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NF2P35240 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NF2P35240 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NF2P35240 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NF2P35240 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NF2P35240 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NF2P35240 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NF2P35240 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NF2P35240 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NF2P35240 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NF2P35240 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NF2P35240 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NF2P35240 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NF2P35240 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NF2P35240 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NF2P35240 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NF2P35240 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NF2P35240 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NF2P35240 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NF2P35240 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NF2P35240 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NF2P35240 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NF2P35240 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NF2P35240 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NF2P35240 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NF2P35240 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NF2P35240 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NF2P35240 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NF2P35240 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NF2P35240 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NF2P35240 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NF2P35240 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NF2P35240 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NF2P35240 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NF2P35240 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NF2P35240 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NF2P35240 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NF2P35240 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NF2P35240 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms