Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM5P33992 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM5P33992 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM5P33992 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM5P33992 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM5P33992 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM5P33992 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM5P33992 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM5P33992 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM5P33992 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM5P33992 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM5P33992 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM5P33992 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM5P33992 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM5P33992 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM5P33992 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM5P33992 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM5P33992 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM5P33992 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM5P33992 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms