Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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