Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LOXP28300 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LOXP28300 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LOXP28300 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LOXP28300 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LOXP28300 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXP28300 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXP28300 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXP28300 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms