Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DMAP28067 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms