Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRGP23470 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms