Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms