Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR1P18146 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR1P18146 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR1P18146 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR1P18146 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR1P18146 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR1P18146 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR1P18146 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR1P18146 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR1P18146 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR1P18146 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms